醫院管理局於二○○五年七月十一日實施「標準藥物名冊」，劃一醫管局轄下所有醫院用藥。名冊內提供「通用藥物」和「專用藥物」，前者是目前廣泛使用藥物，約有一千二百多種。
至於經專科醫生臨床評估而處方的「專用藥物」，公立醫院會以標準收費。惟在「標準藥物名冊」以外的七十三種藥物，雖具療效但昂貴，超出政府一般資助範圍，醫院會為病人提供社區藥房資料，讓其自行購買。
醫院管理局雖指，經濟有困難病人，可通過特設的安全網機制，包括「撒瑪利亞基金」，申請資助某類自費藥物，惟事實上，目前獲得「撒瑪利亞基金」資助的藥物僅四類，包括干擾素、生長激素、治療乳癌藥「紫杉醇」、治療血癌及胃腸基質腫瘤藥「加以域」。
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